-C2-C1-C3东/C3西-C4东/C4西-C5-C1-C6东/C6西，命名为标准型；少数菌株cagA基因3’端氨基酸序列长度较长，具有不同的重复序列数目及组合方式，根据其重复序列数目及组合方式不同，可将这少数菌株cagA基因3’端氨基酸序列分为10种类型，各型氨基酸结构见表1，其中1、7、9、10型仅存在于西方来源菌株，2、3、5、8型仅存在于东方来源菌株，4、6型为东西方菌株共有类型。另外有4株不属于以上10种类型，其中序列号为BAC10429的菌株为东亚型菌株，氨基酸序列间含有一段西方型菌株的重复序列，结构为C1-C2-C1-C3西-C4西-C5-C1-C6东-C5-C1-C6东;序列号为BAC10422、BAC10423、BAC10460的菌株cagA基因3’端氨基酸序列间存在大片段的氨基酸插入。部分序列比对结果见图1。表1 各序列类型氨基酸序列结构 根据年龄（成年）、地域（东亚）匹配条件筛选出网络数据库中已知疾病背景的175条序列，其中萎缩性胃炎（CAG）组42条、消化性溃
疡（PU）组79条、胃癌（GC）组54条cagA基因3’端氨基酸序列，综合分析各重复序列数目及组合方式与疾病类型的关系。结果显示＞4个EPIYA模体的菌株在CAG组检出率（11.90%）明显高于PU组（1.27%，P=0.019<0.05），且含有4个以上EPIYA模体的菌株87.5%是在CAG及GC组中检出见表2。 表2 CagA EPIYA模体数目与不同疾病的关系注：*EPIYA模体数目为5时，CAG组与PU组比较差异有统计学意义（P<0.05） 已知东西方CagA蛋白分别通过EPIYA-C、EPIYA-D位点与SHP-2结合，从而干扰细胞信号传导；本研究分析了EPIYA-C或 EPIYA-D位点数目与临床疾病的关系，发现含多个EPIYA-C/D位点的菌株在胃癌组的检出率显著高于消化性溃疡组的检出率（χ2=4.897，P=0.027<0.05），见表3。表3 特殊序列特征在各疾病类型中的分布 注：*胃癌组与消化性溃疡组比较差异有统计学意义（χ2=4.897，P=0.027<0.05）
在筛选出的少数东方菌株中，重复序列C2、C3的重复次数为2次，C4的重复次数为2～4次、C5、C6的重复次数为2～3次;C4数目=3时，GC组与PU组比较差异有统计学意义（P=0.008<0.05）（表4），其他重复序列数目在不同胃十二指肠疾病中分布差异无统计学意义（P>0.05）。表4 不同C4数目在各疾病类型中的分布注：*C4数目=3时，GC组与PU组比较差异有统计学意义（P=0.008<0.05） 根据重复序列种类、数目及组合方式不同，可将这少数菌株cagA基因3’端氨基酸序列分为10型。而筛选的东方菌株含其中2、3、4、5、6、8型，各序列类型在不同胃十二指肠疾病的分布见表5，其中第6型菌株在胃癌患者中的检出率（11.59%）显著高于在消化性溃疡患者中的检出率（2.17%）（P=0.02<0.05）。 表5 不同序列类型在各疾病类型中的分布注：*第6型菌株在GC患者中的检出率显著高于在PU患者中的检出率（χ2=6.96，P=0.008<0.05）
3 讨论
许多研究证实H.pylori存在明显的地域、致病力差异，cagA是目前已知的H.pylori最重要毒力因子之一。 但不同国家、地区对cagA/CagA阳性菌株感染与胃十二指肠疾病关系的研究报道很不一致［7～11］，其主要原因在于cagA 核苷酸序列及cagA 抗原性具有多态性，cagA磷酸化及其与SHP-2结合活性有差异，导致不同cagA 的致病性存在差异。另外，许多研究所获取的菌株数目较少，尚不能确定不同cagA基因型与临床疾病类型的关系。我们充分利用NCBI的核酸和蛋白数据库中检索到的已知疾病背景的cagA基因3’端可变区碱基和蛋白质氨基酸序列，分析了cagA 3’端结构特征及其与临床疾病的关系。
3.1 cagA 3’端结构特点 同H.pylori其他基因一样，cagA 基因也具有显著多态性，cagA蛋白的大小和抗原性在不同菌株间存在显著差异。cagAg/cagA的多态性主要源于c
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