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中国南方汉族群体HLA |
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田伟 李立新 郭实士 程文 陈继嵩 孙科柱
中国图书分类号 R392.2
HLA-A2是一种主要HLA I类抗原，正式命名的等位基因(截止1997 年)达 22种［1］，本文初步调查了中国南方汉族群体HLA-A2等位基因亚型分布。
1 材料与方法
1.1 研究对象 40名随机选择、无血缘关系的健康汉族个体来自湖南长沙 地区。
1.2 主要试剂 HLA-A2亚型ARMS-PCR分型引物试剂盒(Dynal公司，批号 ：A625)及A*0201(阳性对照)，A*3101(阴性对照)标准DNA由美国Baylor大学罗亚敏博士 赠送。
1.3 外周血白细胞基因组DNA抽提 同文献［2］。
1.4 PCR扩增基因组DNA筛选HLA-A2阳性标本 PCR引物E21、E22、E31序列 同 文献［3］，由美国Genosys公司合成。用E21、E31引物作HLA-A座位类扩增，用E2 2、E31引物做HLA-A2特异性扩增。PCR循环68℃退火1 min，其余参数同文献［3］ 。结果HLA-A2阳性样本两组扩增中均有830 bp的PCR产物条带；HLA-A2阴性标本 仅在 类扩增中有830 bp的PCR产物条带。每批筛选同时做HLA-A2阳性、阴性DNA对照，采用单盲 法重复筛选全部样本。
1.5 ARMS-PCR做HLA-2亚型分析 每份HLA-A2阳性样本同时做24管ARMS -PCR反应以测定所含亚型。具体操作参照试剂盒所附实验手册。所用ARMS-PCR分型试剂盒 可测定HLA-A*0201至A*0222等22种亚型。
1.6 PCR产物直接测序 采用Taq DyeDeoxy Terminator Cycle Sequencing Kit在PE 9600型基因扩增仪上完成测序反应，在ABI377型测序仪上自动测序。
1.7 统计学分析 等位基因频率计算按文献［4］。
2 结果
在全部40例样本中筛选出20例HLA-A2阳性样本，HLA-A2基因频率为0.293，检出A*0201 、A*0203、A*0206、A*0207和A*0211等5种HLA-A2基因亚型，其中A*0201占45%( 9/20)，各亚型频率详见表1。
表1 中国南、北汉族群体HLA-A2基因亚型构成比较
Tab.1 Comparison of HLA-A2 allelic distribution
between southern and no rthern Chinese Han populations
Allele Southern Chinese Han
(40 samples) Northern Chinese Han
(66 samples)［5］
n af(%) g f(%) n af(%) gf(%)
0201 9 22.5 12.0 0 19 28.8 16.7
0203 3 7.5 3.82 2 3.0 1.5
0206 3 7.5 3.82 10 15.2 7.6
0207 4 10.0 5.13 7 10.6 5.3
0211 1 2.5 1.26
Note:n.number of individuals having the specific allele;af.antigen fre quency;gf.gene frequency
3 讨论
根据HLA-A2基因亚型DNA序列差异可分为A*0201和A*0205两大亚群，A*0201见于所有 被调查人群，A*0203、A*0206、A*0207、A*0210仅见于东方人：另一方面，A*02 05、A*0208、A*0209仅见于白人，A*0202、A*0214仅见于黑人，A*0211则可见于 东方人和南美印第安人［5-7］。我们的实验结果也支持这一观点，即HLA-A2等位 基因分布具有明显的种族和地域特征，还检出1例A*0211亚型并由测序证实，表 明 中国南方汉族群体存在该亚型。与白种人中A*0201占全部HLA-A2基因亚型90%以上这一情 形明显不同，中国南、北方汉族群体HLA-A2基因亚型种类较多，频率较为分散，但仍以A *0201为主，该两群体中A*0201，A*02[1] [2] 下一页
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