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植物的功能基因组学研究进展 |
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李子银 陈受宜
摘 要：基因组研究计划包括以全基因组测序为目标的结构基因组学和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学两方面的内容。目前基因功能鉴定的方法主要有：基因表达的系统分析(SAGE)、cDNA微阵列、DNA(基因)芯片、蛋白组技术以及基于转座子标签和T_DNA标签的反求遗传学技术等。本文对上述各种技术的优缺点以及它们在植物基因功能鉴定中的应用进行了综述。
关键词：功能基因组学；SAGE；cDNA微阵列；DNA芯片；蛋白组；反求遗传学
中图分类号： Q943 文献标识码： A
文章编号： 0253－9772(2000)01－0057－60
Progress in Functional Genomics in Plants
LI Zi yin CHEN Shou yi
(Institute of Genetics,Chinese Academy of Sciences,Beijing,100101 China )
Abstract: The genome projects comprise the structural genomics focusing on determining the complete sequences of the genome and the functional genomics focusing on elucidating the biological function of genes.The rapidly evolving tools for functional genomics research include Serial Analysis of Gene Expression (SAGE),cDNA microarray,DNA (or gene) chips,proteome project and the reverse genetics technique based on the wellestablished transposon tagging and TDNA tagging systems.In this paper,the advantages and disadvantages of such techniques and application of these techniques in plant functional genomics research are reviewed and future prospective are also presented.
Key words:Functional genomics;SAGE;cDNA microarray;DNA chips;Proteome;Reverse genetics
以拟南芥和水稻为代表的植物基因组研究已取得了迅速的进展，到目前为止，占拟南芥基因组(100Mb)近三分之一的DNA序列已被测定并在GenBank数据库中登记注册，预期到2001年通过全球合作将完成拟南芥全基因组的序列测定工作。随着植物基因组计划的实施和进展，GenBank中累积了大量的未知功能的DNA序列，如何鉴定出这些基因的功能将成为基因组研究的重点课题，因此，基因组研究应该包括两方面的内容：以全基因组测序为目标的结构基因组学(structural genomics)和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学(functional genomics)研究，后者往往又被称为后基因组(postgenome)研究。
功能基因组研究的内容是利用结构基因组所提供的信息，发展和应用新的实验手段系统地分析基因的功能〔1〕。目前人类和酵母的功能基因组研究已经全面展开，尤其是对已完成全基因组测序的酵母来说，其功能基因组研究任务更加紧迫。植物的基因组研究虽然起步较晚，但由于吸取了人类基因组研究中积累的一些经验，所以进展也相当迅速，对植物功能基因组学的研究目前也已经受到重视，在1998年12月出版的最新一期Plant Cell (10:1771)和Plant Physiol.(118:713)上均编发了关于植物功能基因组学研究的编者按，并由Bouchez和Hofte (1998)〔2〕综述了植物尤其是拟南芥功能基因组学研究的现状，本文在此基础上综述了目前植物功能基因组学研究中使用的主要技术手段以及最新的研究进展。
1 基因功能的含义
基因的功能主要包括：[1] [2] [3] 下一页
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