发生、发展和癌变过程中起着重要作用。越来越多的人认为，酸与环境因素及分子生物学的异常共同促进了BE病程的演变。BE黏膜异型增生中有一系列基因变化起作用，包括DNA非整数倍性变化、细胞增殖标记异常、P53突变等，通过随访监测这些分子标记，可以预测BE癌变及早期诊断食管癌。环氧合酶-2(COX-2)又称前列腺素内氧化还原酶，在正常生理状态下，多数组织不表达，而当受到生长因子、细胞因子、炎症递质、各种促癌因素、细菌内毒素和激素等刺激因素作用时，其表达迅速上调，免疫组化证实，癌细胞、炎症细胞、血管内皮细胞、纤维细胞均明显表达COX-2蛋白。在BE转变为食管腺癌的发生、发展过程中，COX-2过度表达是这一癌变过程中的一种常见形式[14]。
总之，BE与食管腺癌关系密切，如能尽早诊断BE，并积极治疗，使化生的柱状上皮再转变为鳞状上皮，可有效的防止食管腺癌的发生。
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