|
一条KRAB型锌指蛋白全长新基因的克隆与功能初探 |
| |
王兆 应康 林盛榕 吴海 谢毅 毛裕民
摘 要：从人胎脑cDNA文库中克隆到一条全长的锌指蛋白新基因的cDNA，命名为ZNF303。序列分析表明，ZNF303的C末端含有7个保守的锌指基序，N末端含有一个KRAB(Krüppelassociated box)结构域。利用肝癌组织表达谱基因芯片杂交证明，该基因在肝癌组织中的表达量有明显降低。认为这种降低可能跟肝癌的形成和转移有密切的关系。利用辐射杂交基因定位技术，得出该基因在人类染色体上的位置是19q13.2。
关键词：锌指蛋白；KRAB；肝癌
中图分类号：Q751 文献标识码：A 文章编号：0253－9772(2000)04－0247－05
Molecular Cloning and Characterization of a Novel Fulllength
cDNA Encoding Zinc Finger Protein of KRAB Type
WANG Zhao YING Kang LIN Sheng-rong WU Hai XIE Yi MAO Yu-min
（Institute of Genetics,Fudan University,Shanghai 200433，China）
Abstract: We have cloned a fulllength novel zinc finger cDNA of the Krüppel family from human fetal brain cDNA library. Sequence analysis indicates that ZNF303 contains 7 highly conserved zinc finger motifs at the Cterminus and a KRAB(Krüppelassociated box)domain at the Nterminus of the deduced protein.Hybridization using gene chip of hepatic cancer tissue demonstrates the expressive amount in hepatic cancer tissue is lower than control. We hypothecate that the decreasing of expression amount is related to the formation and metastasis of hepatic cancer.Finally,we show that ZNF303 maps on human chromosome 19q13.2 by radiation hybrid.
Key words:zinc finger protein; KRAB; hepatic cancer
DNA结合蛋白在生物体内有着重要的功能，在染色体复制、转录、基因激活和DNA修复中发挥作用［1］。其中具备转录作用的DNA结合蛋白称为转录因子，它们往往具有结合DNA的特定的基序，如螺旋－转折－螺旋(helixturnhelix)、螺旋－环－螺旋(helixloophelix)和锌指(zinc finger)等。而锌指蛋白（zinc finger protein,ZFP）是真核细胞中最普遍存在的一类DNA结合蛋白。根据这些ZFP锌指结构上的特征，可分为C2H2型、C3H4型和C4H4型等。其中C2H2型ZFP构成最大的转录因子家族，在人类基因组中其编码基因约含有300～700个成员。这种蛋白质的结构特点是含有两个或两个以上的锌指单位。锌指单位的基本模式是含有28～30个氨基酸，一致序列为CX2～4 CX3 FX5 LX2 HX3－4 H(X指任何氨基酸)。每两个锌指单位之间的连接区有高度的保守性，通常为TGEKPYX。在C2H2型ZFP中含有功能性结构域，约有1/3的C2H2型ZFP含有KRAB(Krüppel associated box)型结构域。KRAB结构域是由大约75个氨基酸组成，往往存在于ZFP的氨基端，由两个连续的模件A和B构成。研究表明，KRAB型ZFP是起抑制作用的转录因子，KRABA与KRABB之间有协同作用，其抑制作用比单独的KRABA要强［2］。我们从人的胎脑cDNA文库中克隆到一条基因，生物信息学分析表明，该[1] [2] 下一页
上一个医学论文： 不同转移能力的肺腺癌细胞系金属蛋白酶活性分析
下一个医学论文： YR 黏和染色体模型初探 上
|
|
|
|
|
|
|
您现在的位置： 绿色健康网 >> 医学论文 >> 基础医学论文 >> 正文